Maximale spaarzaamheid

Van Wikipedia, de gratis encyclopedie
Spring naar navigatie Spring naar zoeken
Pictogram tools.svg

Vanwege tekortkomingen in vorm of inhoud is dit artikel ter verbetering opgenomen in de kwaliteitszorgbiologie . Dit wordt gedaan om de kwaliteit van de biologieartikelen op een acceptabel niveau te brengen. Help dit artikel te verbeteren! Artikelen die niet significant verbeterd zijn, kunnen indien nodig worden verwijderd.

Lees de meer gedetailleerde informatie in de minimumvereisten voor biologieartikelen .

Maximale spaarzaamheid ( Engels , Duits over maximale spaarzaamheid , zie Ockhams scheermes ) beschrijft in het biologische relatieanalyseproces voor de reconstructie van fylogenetische bomen . De bomen die de minste evolutionaire verandering nodig hebben om de waargenomen gegevens te verklaren, hebben de voorkeur. Maximale spaarzaamheid concurreert met andere methoden, zoals algoritmen voor het samenvoegen van buren en de maximale waarschijnlijkheidsmethode , waarbij elk van deze methoden bepaalde voordelen heeft, maar ook gevoelig is voor bepaalde artefacten .

Een voorbeeld van lange-takattractie . Als takken A en C een groot aantal substituties vertonen in de “echte stamboom” (wat natuurlijk nooit echt bekend is, behalve in simulaties), dan zou de spaarzaamheid deze parallelle veranderingen ( homoplasieën ) kunnen interpreteren als synapomorfisme (gemeenschappelijk kenmerk van twee zustergroepen) en Groep A en C samen.

Met maximale spaarzaamheid zijn de zogenaamde lange-tak-attractie-artefacten (Engels, Duits, bijvoorbeeld artefacten door de aantrekking van lange takken ) mogelijk. Taxa die vanwege een relatief hoog aantal mutaties op lange takken van een stamboom staan, kunnen onjuist op het basale punt in het cladogram worden geplaatst , waardoor de resultaten worden vervormd. Tot kort voor de millenniumwisseling werd het optreden van artefacten met lange vertakkingen als onwaarschijnlijk beschouwd, maar er zijn nu talloze voorbeelden bekend. Sindsdien zijn er veel methoden gebruikt om dit effect te ontdekken of te voorkomen.

literatuur

  • Joseph Felsenstein: gevallen waarin spaarzaamheid of compatibiliteitsmethoden positief misleidend zijn . In: Systematische biologie . plakband   27 , nee.   4 , december 1978, p.   401-410 , doi : 10.1093 / sysbio / 27 april 401 .
  • Bryan Kolaczkowski, Joseph W. Thornton: Prestaties van maximale spaarzaamheid en waarschijnlijkheidsfylogenetica wanneer evolutie heterogeen is . In: Natuur . plakband   431 , nee.   7011 , mei 2004, p.   980-984 , doi : 10.1038 / nature02917 .
  • Johannes Bergsten: een overzicht van attractie met lange vertakkingen . In: Cladistiek . plakband   21 , nee.   2 , april 2005, p.   163-193 , doi : 10.1111 / j.1096-0031.2005.00059.x .